劳动者迟到属于违反劳动纪律，用人单位应当有权在规章制度或企业奖惩制度中，对此类行为进行一定的处罚，以实现双方的权利义务平等。公司依法有权对员工的违规行为作出处罚，但前提是公司有处罚依据，并且是合法制定的。所谓的迟到扣钱其实是对工资的扣除，这个是合法的，因为违反了公司的制度，但是劳动法和工资支付暂行规定也规定了公司对于迟到员工的处罚不得超过当月工资的20％，另外扣发完工资后不得低于最低工资标准。

公司制度扣工资合法吗

公司制度扣工资不合法，在用人单位扣一个月工资时，劳动者可以解除劳动合同，要求单位支付未发放工资并要求单位支付经济补偿金。依据《劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者工资。《劳动合同法》第三十八条用人单位有下列情形的，劳动者可以解除劳动合同：未及时足额支付劳动报酬的。第四十六条：有下列情形的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿：劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的。

《中华人民共和国劳动法》第十七条订立和变更劳动合同，应当遵循平等自愿、协商一致的原则，不得违反法律、行政法规的规定。劳动合同依法订立即具有法律约束力，当事人必须履行劳动合同规定的义务。