员工上班迟到被扣工资是否违法，具体如下：

1、如果因劳动者迟到的原因造成公司损失的，可以扣除工资；

2、如果因劳动者迟到没有造成公司损失的，迟到扣工资是违法的。

一、劳动者违反规定解除劳动合同，应赔偿用人单位下列损失：

1、用人单位招收录用其所支付的费用；

2、用人单位为其支付的培训费用，双方另有约定的按约定办理；

3、对生产、经营和工作造成的直接经济损失；

4、劳动合同约定的其他赔偿费用。

二、用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同：

1、未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件的；

2、未及时足额支付劳动报酬的；

3、未依法为劳动者缴纳社会保险费的；

4、用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益的；

5、用人单位致使劳动合同无效的；

迟到罚款合法吗

目前许多用人单位出于合规性考虑，采取“基本工资＋绩效工资”的薪酬制度，并将考勤作为绩效考核的重要评定指标。如果员工出现迟到、早退及旷工，用人单位减少支付相应绩效工资，法院认为这属于用人单位合理行使管理和用工的自主权的行为，并不违反法律规定。

《关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释》第19条规定：“用人单位根据《劳动法》第4条之规定，通过民主程序制定的规章制度，不违反国家法律、行政法规及政策规定，并已向劳动者公示的，可以作为人民法院审理劳动争议案件的依据。”