迟到公司扣钱是否合法，要根据实际情况来决定。但是，如果用人单位在规章制度中明确了迟到早退要扣工资，并将规章制度公示并告知职工，那么，迟到扣款是合法的。当然，反之，如果用人单位没有相关的规章制度，或者不公示相关规章制度并告知职工，那么就不能以迟到为由扣工资，否则就是违法的。

上班迟到早退扣工资合法吗

上班迟到早退造成用人单位损失的，用人单位可以通过劳动合同约定扣工资，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％。用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资的，由劳动行政部门责令其支付劳动者工资和经济补偿，并可责令其支付赔偿金。

《工资支付暂行规定》第十六条：

因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。