没有关系。档案工资是指参加工作后按照国家政策给予定级后的岗位级别工资和薪级工资；实际工资是指在单位工作，获得的实际劳动报酬。档案工资仍有其存在的必要性，如：档案工资是作为缴纳各项保险的基数、工作人员调动和退休时的工资依据等。因此，档案工资与实际工资分离后，应有专人对档案工资进行管理。

合同工资与实际工资不符合该怎么办

合同工资与实际工资不符合可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

1、如果用人单位仍然不按照劳动合同执行，则劳动者可以去劳动仲裁委员会要求仲裁，按照劳动合同规定的工资标准进行发放；

2、由于用人单位违反劳动合同内容，劳动者也可以要求与用人单位解除劳动合同并要求用人单位给予一定的经济补偿。

工资总额由下列组成：

1、计时工资；

2、计件工资；

3、奖金；

4、津贴和补贴；

5、加班加点工资。

《中华人民共和国社会保险法》第九十条社会保险费征收机构擅自更改社会保险费缴费基数、费率，导致少收或者多收社会保险费的，由有关行政部门责令其追缴应当缴纳的社会保险费或者退还不应当缴纳的社会保险费；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分。