旷工三天扣9天工资是不合法的。

旷工是指员工请假没有获得批准或没有履行请假手续而未到岗上班的行为。员工旷工的，用人单位可以不支付其没有提供劳动期间工资，但不能作额外的惩罚性罚款。

员工工作一天可获得一天的工资，缺勤一天，用人单位可以不支付当天工资。但规定旷工三天扣9天工资是不合法的，这就涉嫌克扣工资了。

员工扣罚工资为负数是否合法

不合法，原则上用人单位不得对员工工资进行扣罚，除非员工给用人单位造成了实际经济损失，或者按照规章制度的规定，用人单位可以对员工进行经济处罚，但不超过当月工资的20％。具体规定如下：

《劳动合同法》第四条

用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。

用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。

在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。

《劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。