员工旷工一天扣三天工资不合法。因为劳动者旷工一天可以扣当天的工资，如果扣三天工资则多扣的两天就涉嫌克扣工资；

而我国《劳动法》又规定，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资，所以工旷工一天扣三天工资不合法。

员工旷工一天单位有权辞退吗？

娄某：我是安徽人，三年多前来北京打工，不久被设备安装公司招为安装员。我们是按件计发奖金，而每项安装工作的奖金有高有低，负责分配的主管总是把难干、钱少的活儿给我，为此上周我跟他吵了一架，当时我非常生气就离开了公司，结果被记了一天旷工。近日，主管说我无故旷工被单位辞退了，让我赶紧办离职手续。请问：公司能因为旷工一天就辞退我吗？

律师：根据《劳动合同法》第39条规定，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。所以，在您本人严重违反规章制度的情形下，用人单位可以单方解除劳动合同而不需要支付经济补偿金。但您所述的旷工一天是否构成严重违反用人单位规章制度，依赖于用人单位向您下发的并且您已签收的规章制度中是否有明确规定，如果没有相关的规章制度，或者规章制度中无旷工一天为严重违反规章制度行为的相关规定，那么您所在单位与您解除劳动关系的行为构成违法解除，应当向您支付经济赔偿金。

《劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。