公积金缴存基数是应发工资。应发工资指的是不扣除相应社保，个税等的工资数额，以这个为基数确定社保公积金的缴纳档次，实发工资指的是扣除社保和个税等之后实际发个员工的金额。

一、工资5000要交多少税

员工在扣除社保和住房公积金之后，剩余部分应该达到31275元，个人所得税就需要缴纳5000元。使用个人所得税反推员工工资，那么需要知道个人所得税征收的原则。个人所得税是在员工扣除社保以及住房公积金之后超过3500元部分，按照一定税率进行计算的。而且超出部分也是按照金额进行等级划分，不同等级的金额按照不同的税率进行计算。

二、上海5000工资扣除五险一金

上海从4月份开始调整了今年的社保最低缴纳基数为3563元，公积金要到7月调整，5000一个月扣除五险一金还剩多少，不太好回答，因为每个企业的缴纳基数不一样，而且公积金基数不定的，有多也有少。社保为3563元为基数的话，个人缴纳10.5%，也就扣除375元最多了，公积金如果给你以3000元缴纳基数缴纳的话，你需要交210元所以5000元的税前工资，到手5000-375-210=4415元，这个数还超过了3500元的个税起征点，所以拿到手在4200--4400之间。

三、个税和社保基数不一致

个税和社保基数不一致，是因为每个人所在岗位的工资不一致。社保的计费工资一般一年一变动，确定一个基数，一年之内都不改变，但一年的总额应该和申报个人所得税的计税工资一致。但实际工作中往往不一致，这是社保这一块的工资基数管理监督还不到位，很多单位总是以最低基数缴纳社保。