可以先和用人单位的负责人，了解具体情况，询问扣工资原因，经协商解决。若协商不成，还可以向劳动纠纷调解委员会申请调解，或者直接向劳动监察大队投诉，用人单位的克扣工资行为。还可以向劳动争议仲裁委员会，申请仲裁；如果对仲裁的结果感到不满意，还可以向人民法院提出诉讼。

员工被克扣工资怎么办？

1、可以到劳动行政部门举报（通常是劳动管理监察大队）。

2、也可以直接申请仲裁（仲裁费用200－300元，如果你胜了全部由公司负担）。

3、如果对仲裁结果不满意可以在拿到仲裁书后15天之内到法院起诉。

4、根据国家规定在仲裁或诉讼的时候，你可以要求除在规定的时间内全额支付劳动者工资报酬外，还需加发相当于工资报酬百分之二十五的经济补偿金。

按照《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》的规定，用人单位克扣或无故拖欠工资的，除了支付就业者工资报酬外，还应加发相当于工资报酬25％的经济补偿金。克扣工资不包括以下情况：1、国家法律、行政法规中有明确规定的。2、依法签订的劳动合同中明确规定的。3、已制订并且经过职工代表大会批准的用人单位内部规章制度中规定的。4、用人单位工资总额与经济效益相联系，经济效益下浮时就业者工资必须下浮的。5、就业者请事假减发的工资等。