因员工怀孕克扣员工的工资可以申请劳动仲裁，并且还可以要求公司补足已扣减的工资或者继续履行劳动合同。根据我国有关法律法规，用人单位不可以因为女职工怀孕、生育、哺乳而减薪、解聘、解除劳动合同或者聘用的合同。女职工在怀孕期间不能适应原劳动的，用人单位应该要根据医疗机构的证明减少女职工的劳动量，或者安排其他适当的劳动。对怀孕七个月以上的女职工，用人单位不可以延长女职工的工作时间或者安排夜班工作，并且还要在工作时间内安排一定的休息时间。怀孕的女工在劳动时间内进行产前检查，所需的时间计入劳动时间。

员工怀孕哪些情况可以辞退

女职工在孕期、产期、哺乳期的，用人单位不得依照《劳动法》第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。但是，依据《劳动法》第二十五条以及《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条相关规定，劳动者有如下情形之一，用人单位有权依法解除与怀孕女职工的劳动关系：

1、严重违反劳动纪律或者用人单位规章制度的；

2、严重失职、营私舞弊，对用人单位利益造成重大损害的；

3、或劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；

4、被依法追究刑事责任的，用人单位无需支付经济补偿金。但如果并非上述情形，用人单位辞退哺乳期女职工，用人单位应支付经济补偿金、额外经济补偿金等。

因此，用人单位是不能随意解雇哺乳期女职工的。女职工在哺乳期内，用人单位不得解除劳动合同。用人单位在女职工哺乳期内强行与其解除劳动合同，是违反我国法律规定的行为。

《中华人民共和国劳动合同法》第六条规定：女职工在孕期不能适应原劳动的，用人单位应根据医疗机构的证明，予以减轻劳动量或者安排其他能够适应的劳动。对怀孕7个月以上的女职工，用人单位不得延长劳动时间或者安排夜班劳动，并应当在劳动时间内安排一定的休息时间。怀孕女职工在劳动时间内进行产前检查，所需时间计入劳动时间。