公司扣工资是不合法的，我国法律规定用人单位不能减扣或者拖欠劳动者的工资，否则需要承担一定的法律责任。公司扣工资可以先和用人单位协商，协商不成功可以申请劳动仲裁。

一、公司扣工资合法的吗

公司扣工资不合法的。

我国《劳动法》第50条规定，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。克扣劳动者工资，是用人单位违法或违反劳动合同、集体合同的约定，没有正当理由扣减劳动者应得工资报酬的行为。除法定允许代扣工资的情况外，用人单位一律不得克扣或无故拖欠劳动者工资，否则，要承担相应的法律后果。

一般说来，有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：用人单位代扣代缴的个人所得税;用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用;法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、扶养费、赡养费;法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。不属于上述情况，用人单位不得代扣劳动者工资。

二、公司扣工资可不可以劳动仲裁

公司扣工资是可以进行劳动仲裁的，依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条中华人民共和国境内的用人单位与劳动者发生的下列劳动争议，适用本法：

1.因确认劳动关系发生的争议;

2.因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议;

3.因除名、辞退和辞职、离职发生的争议;

4.因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议;

5.因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议;

6.法律、法规规定的其他劳动争议。

三、公司扣工资多少算违法

劳动者因本人原因给单位造成经济损失，用人单位依法要其赔偿，并需从工资中扣除赔偿费的，扣除的部分不得超过劳动者当月工资收入的20%，且扣除后的剩余工资不得低于最低工资标准。也就是说，这种扣减也是有一定限度的，一旦超过了最低工资标准这条底线，就属于克扣工资了。

我国《劳动法》第二十五条规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资，按月支付即包括工资应当以月薪的形式发放，也包括应当每月支付，因此用人单位应当在自然月结束的30天内结算工资，超过30天即构成拖欠工资。