迟到按分钟数扣工资合法，除此之外，用人单位应依法在规章制度中明确上班迟到扣除工资的要求及标准，并已进行公开公示告知员工，且所扣工资必须少于劳动者当月工资的20%；与以上任何一点相悖的，则迟到扣工资不合法。

一、公司克扣员工工资合不合理

用人单位克扣工资不合理，无故克扣工资的，劳动者可向劳动监察大队举报；但劳动者违反用人单位的规章制度，且用人单位已依法在规章制度中明确扣除工资的要求标准并已率先进行公开公示告知员工可视作合理，所扣工资必须少于劳动者当月工资的20%。

二、迟到太多被辞退会有补偿吗

如果公司的规章制度对迟到早退有规定，并明确某一时间段内迟到早退多久多少次是严重违反公司规章制度的行为，且在员工早已知晓的情况下，是可以辞退的。

迟到太多被辞退有补偿的具体分析如下：

1、如果累计到严重违反公司制度的程度是没有补偿的；

2、如果达不到严重违反公司制度的程度，应该支付你赔偿金，工作1年支付2个月工资。劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的，因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的。

三、迟到是否扣全勤

员工迟到没有全勤奖。全勤奖制度：

公司当月规定的工作时间内未迟到、早退、请假、旷工，公司给予全勤奖；

1、以上由考勤卡计算，以公司标准工作时间为准；

2、市场部自行考勤，不计全勤奖；

无论是请事假还是病假，本月全勤奖扣除100％；

旷工当月扣除100％全勤奖；

不服从安排怠工、停工、擅自离岗影响正常工作的扣除本月全勤奖。