工资总额不是实际工资。应付工资总额是指用人单位应当向劳动者支付的工资报酬。实际工资总额是指用人单位扣除五险一金个人承担的部分，扣除个人所得税后支付给劳动者的工资总额。一般来说，应发工资总额高于实发工资，因为实发工资是扣除五险一金后的应发工资总额，肯定会少于应发工资总额。两者无法相比，所以当实发工资与应发工资总额不匹配时，不用怀疑。

双倍工资是基本工资还是实发工资

双倍工资是实发工资。关于经济补偿金的工资计算标准，一般包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、延长工作时间的工资报酬以及特殊情况下支付的工资等。经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。劳动者在劳动合同解除或者终止前12个月的平均工资低于当地最低工资标准的，按照当地最低工资标准计算。

《中华人民共和国劳动法》第四十七条用人单位根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。