公司没有正当理由扣除工资，员工可以采取以下方式维护自己的权益：

1、与公司协商。公司扣除工资的，应当说明扣除工资的理由和有关规章制度，而且相关规章制度已经提前公布，否则公司无正当理由扣工资，

是不合理的违法行为，员工可以要求公司全额支付工资和相应的利息损失；

2、协商不成的，可以向当地劳动监察大队投诉，要求协助解决；

3、未解决的，可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁；

4、劳动仲裁生效后，公司拒绝执行、拒绝支付的，可以申请法院强制执行。

遭遇公司克扣工资怎么维权

1、双方协商解决。首先劳动者应该跟公司协商，在和平友好的条件下达成一致；

2、申请调解。劳动者遭遇克扣工资可以向劳动纠纷调解委员会申请调解。调解程序也由当事人自愿选择，调解协议不具有强制执行力，如果一方反悔，同样可以向仲裁机构申请仲裁；

3、提请处理。劳动者可以将劳动纠纷直接提请处理，劳动仲裁程序是劳动纠纷的前置程序，只有经过劳动仲裁裁决后，才可以进行劳动纠纷诉讼；

4、诉讼解决。通过诉讼方式解决劳动纠纷是由不服仲裁委员会裁决的一方当事人向人民法院提起诉讼。也就是说劳动者因为工资等问题，对劳动仲裁的裁决不满意而想法院提起诉讼。

《中华人民共和国劳动法》第九十一条用人单位有下列侵害劳动者合法权益情形之一的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金：

（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的；

（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的；

（三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；

（四）解除劳动合同后，未依照本法规定给予劳动者经济补偿的。