工资分两笔打入的原因可能是由于公司合理避税，减少交纳税款。工资应当缴纳个人所得税。综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率。经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率。

一、劳务报酬个税是由谁交

劳务报酬个税由报酬所得人交。

个人所得税的税率：

1、综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率；

2、经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率；

3、利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。

支付劳务报酬的行政事业单位，必须按照税法要求的扣缴义务人在向个人支付应纳税所得包括现金支付、汇拨支付、转账支付和以有价证券、实物以及其他形式支付时，不论纳税人是否属于本单位人员，均应代扣代缴其应纳的个人所得税税款，否则，纳税人应缴纳的税款由扣缴义务人补缴，认真履行职责，严格办理劳务报酬的支付。

二、工资交税比例

工资属于综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率。《个人所得税法》第三条，个人所得税的税率：(一)综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率。(二)经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率。

三、基本工资税收标准

1、工资、薪金所得，适用超额累进税率，税率为百分之三至百分之四十五。

2、个体工商户的生产、经营所得和对企事业单位的承包经营、承租经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率。

3、稿酬所得，适用比例税率，税率为百分之二十，并按应纳税额减征百分之三十。

4、劳务报酬所得，适用比例税率，税率为百分之二十。对劳务报酬所得一次收入畸高的，可以实行加成征收，具体办法由国务院规定。