可以，公司以私人账户发工资不影响仲裁，因为属于劳动者所发生的一些争议，是可以按照相关法律来进行一定的规制处理的，仲裁委是可以认定即使是个人账户支付的工资，同样可以证明劳动者与单位存在劳动关系。

一、不发工资去哪里进行投诉

向用人单位所在地的劳动局投诉；向用人单位所在地的劳动仲裁委投诉。

如果用人单位不发工资或者劳动者与用人单位因工资支付发生劳动争议的，当事人可依法向劳动争议仲裁机关申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。

劳动者在拖欠工资的维权中需注意：

1、要确认和单位之间的劳动关系的事实，如工资单，考勤记录，工作过程中的文件记录。

2、确认劳动关系后，对于单位拖欠工资的违法行为，可与老板协商，要求单位补发工资。

3、如果协商不成，带好相关资料到劳动局投诉，或者直接到单位所在地的劳动仲裁委提出劳动仲裁。

4、如果拖欠工资数额比较大的话，可以直接请律师打官司，通过诉讼的方法来要回被拖欠的工资。

二、事实劳动关系解除补偿标准是怎样的

如果是由劳动者提出解除事实劳动关系的，则根据目前的规定，劳动者有权随时提出解除事实劳动关系，但用人单位是不必支付经常补偿金的。

但如果是由用人单位提出解除事实劳动关系的话，则以前的各地的规定和做法都是不同的，与目前的规定有区别了，我们根据目前劳动部的规定来看：根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》的规定，用人单位提出终止劳动关系的，应当按照劳动者在本单位工作年限每满一年支付一个月工资的经济补偿金。如果劳动者与用人单位就是否存在劳动关系引发争议的，或对用人单位是否应支付经济补偿金发生争议的，都可以向有管辖权的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。一般有管辖权的劳动争议仲裁委员会是指用人单位所在地或者劳动者工资关系所在地的仲裁委员会。