公司扣绩效工资要根据具体情况进行判定。绩效工资指的是按照工作的要求和制定的标准进行相应的扣除，公司有权扣除但是不能随意扣除。劳动者和用人单位建立劳动关系，用人单位不得非法对劳动者进行罚款，用人单位非法克扣劳动者的工资属于违法行为，企业以罚款条数来扣绩效工资是不合法的。

一、迟到扣工资有法律依据吗

迟到扣工资违法，普通用人单位不具备罚款权，但可以扣除相应时间未提供劳动部分的工资。同时，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，对用人单位赔偿可以通过扣除工资，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。

二、请三个小时假扣全勤合理不

请三个小时假扣全勤不合理。用人单位应当按照劳动合同规定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬，扣一天工资即可。但是，如果员工的旷工行为直接导致公司经济损失，可以要求赔偿，而不能一律规定为扣工资。如果用人单位未及时足额支付劳动报酬的，劳动者是有权利与公司解除劳动合同的，对于这样的情况公司还需要额外向劳动者支付经济补偿金的，也就是对于不主张员工权利的公司，作为劳动者是有理由与公司解解除劳动合同并获得赔偿的。在工作生活中遇到了公司以这种名义克扣工资时，作为劳动者，公司如果按照三倍扣除工资，这是不合理的，有理由也有权利与公司进行理论。如协商不成，建议马上向当地的劳动行政部门来进行投诉，由该行政部门介入查处，坚决杜绝这种不合理规章制度的出现。

三、用人单位对违纪员工罚款是合法的吗

用人单位对违纪员工罚款是不合法的，用人单位无权罚款。但因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，应当承担赔偿责任，可从劳动者本人的工资中扣除。每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。劳动者严重违反用人单位规章制度的，用人单位可以单方面解除劳动合同。