1、员工不能胜任工作的，可以通过以下几方面认定：

（1）、企业的规章制度的规定

企业在规章制度中，应当对不胜任工作着一模糊性的法律概念，基于自己企业的实际情况，作出细致性地表述，要具体罗列出哪些行为属于不胜任工作的表现，有了这个，对于后期对不胜任工作的认定，会有很大的帮助。

（2）、对员工的考核结论

不胜任工作，需要有员工的考核结论作为依据，而且这一考核结论需要对员工进行告知方可。没有告知的考核结论是没有法律效力也没有证明效力的。员工可以不认可考核结论，但是企业不能不告知员工考核结论。

（3）、员工工作中表现的具体罗列

对于员工不胜任工作这一结论，需要从员工的工作表现中具体体现。所以企业要对员工的工作表现做一个概括性的表述，这一表述要体现出员工的哪些行为，使企业认为不能胜任工作。这些表现无需员工认可，但是企业应当进行总结，以求在后期仲裁或者沟通的过程中。使企业的不胜任工作这一结论，能够足够的实际表现支持。

2、法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第四十条【无过失性辞退】

企业员工不能胜任工作被辞退如何赔偿？

公司如果要以不胜任工作为由辞退你，首先公司要有相关的考核，其次要对你进行专项培训或者进行调岗，如果还不行的话，才能辞退你，不需要给补偿。不满足前面两项，公司以不胜任工作为由辞退你，那就是违法解除，你可以申请劳动仲裁，要求双倍赔偿金。