公司规定迟到超过5分钟，一次扣30块钱，这样的做法是违法的。劳动法规定，除了职工给用人单位造成经济损失外，是不能扣款的。

一、上班迟到扣款合理吗

上班迟到扣款合理。用人单位可以制定用人制度来明确规定迟到后的处罚措施。如果用人单位在规章制度中明确迟到早退要扣工资，并将规章制度公示并告知职工，那么，迟到扣款是合法的。如果用人单位没有相关的规章制度，或者不公示相关规章制度并告知职工，那么就不能以迟到为由扣工资，否则就是违法行为。

二、上班迟到算迟到工资吗

劳动者迟到属于违反劳动纪律，用人单位应当有权在规章制度或企业奖惩制度中，对此类行为进行一定的处罚，以实现双方的权利义务平等。公司依法有权对员工的违规行为作出处罚，但前提是公司有处罚依据，并且是合法制定的。因此，罚款是否合法，一看公司是否有相关规章制度规定;二看规章制度是否合法。如果公司没有相关规章制度规定，作出处罚是没有依据的，是违法的。但严格的讲公司对于迟到不是罚款，罚款是行政处罚的一种，必须有行政立法机关进行立法规定。因为公司不是行政执法机关，没有罚款权限。所谓的罚款其实是对工资的扣除，这个是合法的，因为违反了公司的制度，但是法律规定也规定了公司对于迟到员工的处罚不得超过当月工资的20%，另外扣发完工资后不得低于最低工资标准。