1．用人单位代扣代缴的个人所得税；

2．用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；

3．法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；

4．员工给企业造成经济损失，企业可以根据劳动合同约定，从员工的工资中扣除损失的赔偿。（需要注意的是，此情形下扣工资需要提前在劳动合同中约定，或者在产生经济损失后双方协商一致，并订立协议。此外每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％，且扣除后员工的工资不得低于当地最低工资标准。）

5．企业出资为员工进行专项培训，签订服务期协议，如果员工违反协议约定离职，企业可以要求员工支付违约金。

如果服务期协议中有约定，那么员工违反协议离职，企业可以从员工工资中扣除培训费用。

6．员工向公司借款，约定可以从工资中扣除。

7．迟到、早退、旷工，需要注意的是，员工迟到、早退1个小时只能扣1个小时的工资，旷工一天只能扣一天的工资，不得放大员工的违纪行为。

个人独资企业扣除员工工资的合法依据是什么

《工资支付暂行规定》

第十五条用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：

（一）用人单位代扣代缴的个人所得税；

（二）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；

（三）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；

（四）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。