派出所所长是属于行政机关工作人员，派出所所长违纪的，要接受纪律的处罚，依据违纪的情形作出相应的处罚，如警告、降级、开除等。

相关法律规定

《行政机关公务员处分条例》

第六条行政机关公务员处分的种类为：

(一)警告；

(二)记过；

(三)记大过；

(四)降级；

(五)撤职；

(六)开除。

第七条行政机关公务员受处分的期间为：

(一)警告，6个月；

(二)记过，12个月；

(三)记大过，18个月；

(四)降级、撤职，24个月。

第八条行政机关公务员在受处分期间不得晋升职务和级别，其中，受记过、记大过、降级、撤职处分的，不得晋升工资档次；受撤职处分的，应当按照规定降低级别。