公司账上给员工发工资个人所得税是直接从工资里扣的，即在发放工资时已经将个人所缴纳的个人所得税直接从工资里扣除发放。

一、个税是怎样扣除

个人所得税一般由公司代扣代缴。个人所得税=（工资总额-五险一金-5000）×税率-速算扣除数。个人所得税的征收方式可分为按月计征和按年计征。个体工商户的生产、经营所得，对企业事业单位的承包经营、承租经营所得，特定行业的工资、薪金所得，从中国境外取得的所得，实行按年计征应纳税额，其他所得应纳税额实行按月计征。

一般来说，个税都是公司直接在员工工资里面扣除，然后代替员工进行缴纳他们的个税的，是不需要员工自己去缴纳的。

二、工资的个人所得税如何交

如果是公司的职工的话，工资薪金所得税是实行扣缴制。员工在收到工资以前，员工所在的单位会先到地税局办理代扣代缴的手续，会先把税缴纳之后再将工资发放给员工。公司的财务人员会在发放工资之前先根据每个人的工资，算出需要缴纳的税收。

三、补发工资怎么算税呢？

这样计算：目前的普遍做法是允许还原至所属月份计算缴纳个人所得税，计算公式为:所属月份补发工资应纳税额=[(所属月份补发工资+原所属月份的工资薪金所得)―费用减除额]×适用税率-速算扣除数]—原所属月份已缴纳的个人所得税。