当购房者在交房时发现实际面积小于合同面积时，如何保护产权首先需要计算实测面积与合同面积的误差是否超过3%。其次，要认真查阅合同，看是否有相应的“面积确认和差错处理办法”的规定。因为根据《最高人民法院关于审理商品房买卖合同纠纷适用法律若干问题的解释》第十四条规定，出卖人交付的房屋建筑面积或者建筑面积与商品房买卖合同约定的面积不一致的合同中，按约定处理；合同中无约定或约定不明确的，按以下原则处理：

（1）面积误差率绝对值在3%以内（含3%），按合同约定价格结算，买受人要求解除合同的，不予支持；

（2）面积误差率绝对值超过3%，买受人要求解除合同并返还已付购房款及利息的，不予支持。买方同意继续履行合同。房屋实际面积大于合同约定面积的，面积误差率小于3%（含3%）的部分由买受人补足，面积误差率大于3%的部分由出卖人承担，所有权属于买受人；房屋实际面积小于合同约定面积的，出卖人应当将面积误差率小于3%（含3%）部分的房价及利息返还买受人，面积误差率大于3%部分的房价双倍返还买受人。因此，首先，我们需要计算比合同面积少5平方米的实际面积是否超过3%的误差率。超过限额的，可以依法向开发商索赔。另外，我想提醒您，如果合同中有关于“面积确认和差错处理”的约定或条款，该约定或条款也具有一定的法律效力。因此，购房人在买房前一定要仔细核对合同后再签字，而当收到房子后出现问题时，也一定要仔细核对购房合同。