1、缺勤者不得扣除员工的工资。缺勤者只能按事假扣除工资。也就是说，缺勤者当天没有工资，不能一天罚款三天等，这种做法是违法行为。2、缺勤行为在很多公司都是严重违反纪律的行为，有被开除的可能性，但公司不能扣除员工上班的工资。3、有些公司不是直接扣除工资，而是按照规章制度的规定进行行行政处罚。4、对于缺勤者扣除工资的行为，首先与公司协商解决，无法协商的，可以向公司所在地的劳动监察大队投诉立案处理。

公司扣全部工资合法吗

违反公司规定扣除全部工资不合法。劳动者违反公司规定给用人单位造成经济损失的，可从劳动者本人的工资中扣除弥补经济损失。每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％，扣除过多时可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。

《劳动保障监察条例释义新》第十条