两份工资各自5千要扣个税。工资个税的计算公式为：应纳税额=（工资薪金所得-“五险一金”-扣除数）×适用税率-速算扣除数。工资范围在5000-8000元之间的，适用个人所得税税率为3%。如果工资是分两次发，应合并两次工资所得，一起征收个人所得税。工资范围在8000-17000元之间的，适用个人所得税税率为10%。缴纳个税多少跟分两次发关系不大，跟两次工资所得的合并金额有关。

一、深圳个人工资扣税规定

工资个税的计算公式为：应纳税额=(工资薪金所得-“五险一金”-扣除数)×适用税率-速算扣除数；个税起征点是5000，使用超额累进税率的计算方法如下：缴税=全月应纳税所得额*税率-速算扣除数；实发工资=应发工资-四金-缴税；全月应纳税所得额=(应发工资-四金)-5000扣除标准：个税按5000元/月的起征标准算。

二、工资怎么扣税计算

个人所得税实行源泉扣缴和自行申报两种征收方式，支付所得的单位或个人为个人所得税的扣缴义务人；在两处以上取得工资薪金所得和没有扣缴义务人的，以及有扣缴义务人，但扣缴义务人没有依照税法规定代扣代缴税款的，纳税义务人应当自行申报纳税。

工资个税的计算公式为：应纳税额=(工资薪金所得-“五险一金”-扣除数)×适用税率-速算扣除数个税起征点是5000，使用超额累进税率的计算方法如下：缴税=全月应纳税所得额*税率-速算扣除数实发工资=应发工资-四金-缴税。全月应纳税所得额=(应发工资-四金)-5000。