1、新个税下两份工资应当分别将两份工资进行核实后，由个人申报，不可以由一方单位代理合并申报纳税。以每月收入额减除费用五千元后的余额为应纳税所得额。

2、法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》第二条，下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：

(一)工资、薪金所得；

(二)劳务报酬所得；

(三)稿酬所得；

(四)特许权使用费所得；

(五)经营所得；

(六)利息、股息、红利所得；

(七)财产租赁所得；

(八)财产转让所得；

(九)偶然所得。居民个人取得前款第一项至第四项所得(以下称综合所得)，按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。

一、税务零申报什么意思

纳税申报的所属期内没有发生应税收入(销售额)，同时也没有应纳税额的情况，称为零申报。

零申报的条件如下：

1、办理了税务登记就要到税务机关进行纳税申报，这个征管法规定的。

2、至于到哪个税务机关进行纳税申报，要看你涉及哪个税种，你就要到管理这税种的税务机关去进行纳税申报。

3、一般的，如果你是工业或商业，那国税地税都要去进行纳税申报的，如果你是服务业，那也是两边都要跑的，中外合资和新企业，大部分的税都是国税管，只有城市房地产税和印花税、个人所得税这几个是地税管，外商企业的城建税、教育费附加这些都是免的。

4、你现在没有收入，你到税务机关要相关税收的申报表，然后在空表上盖章去交就行了。

5、有些申报表有不能报空表的，比如个人所得税申报表，如果有职工的月工资超过3500的，就可能要扣税，还有印花税申报表，那根据注册资本×万分之五，城市房地产税申报表。是根据公司的土地和房产价值算的。