加班旷工扣工资的计算方式是扣除当天没有来上班的那天的基本工资。

1、旷工不得克扣员工工资，旷工只能按事假扣工资，也就是说旷工当天没有工资，不能旷一天罚三天等等，类似做法属于违法行为。

2、旷工行为在很多单位属于严重违规违纪行为，可能会被开除，但单位不能扣押员工已上过班的工资。

3、有的单位会用其他方式，如按规章制度规定进行行政处罚，而不是直接克扣工资。

4、对于旷工扣工资的行为，可以先与单位协商解决，协商不成的，可以到单位所在地劳动监察大队去投诉立案处理。

一、旷工几天可以解除劳动合同？

至于旷工几天单位可以解除劳动合同，单位可以制定单位内部管理制度，根据情况自己制定。我国法律上对员工旷工是没有做出规定的，但实践中用人单位可以根据内部管理制度对旷工员工做出相应的处罚。其中一项就是要扣除旷工员工在旷工期间的工资，一般是按照旷工的天数乘以旷工员工的日工资来计算的。同时，要是因员工的旷工，造成了公司的损失，那么公司可以要求员工进行赔偿。

劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：

1、在试用期间被证明不符合录用条件的；

2、严重违反用人单位的规章制度的；

3、严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；

4、劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；

二、职工旷工能否起诉单位?

员工旷工是属于严重违纪行为。员工有严重违纪的情况，单位可以辞退员工，且并不需要支付员工经济补偿。根据单位管理规定的不同，针对员工旷工行为的处罚也是不一样的。法律中并没有规定员工需要连续旷工几天才能辞退该员工。只要有旷工行为，单位即可以此辞退员工，决定权在单位。