用人单位违反劳动合同应赔偿劳动者的损失有：造成劳动者工资收入损失的，按劳动者本人应得工资收入支付给劳动者，加付应得工资收入25％的赔偿费用；造成劳动者劳动保护待遇损失的，按国家规定补足劳动者的劳动保护津贴和用品。

关于违反劳动合同的责任问题？

根据《劳动法》第十九条规定，用人单位与劳动者可在劳动合同中约定违反劳动合同的责任，但必须经双方当事人平等协商，不能由任何一方单独决定。只要约定内容不与法律、法规、规章相抵触，且公平、合理、合乎实际，劳动争议仲裁委员会可将其作为处理劳动争议的依据。？

《劳动合同法》第八十条

用人单位直接涉及劳动者切身利益的规章制度违反法律、法规规定的，由劳动行政部门责令改正，给予警告；给劳动者造成损害的，应当承担赔偿责任。

第八十二条

用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。用人单位违反本法规定不与劳动者订立无固定期限劳动合同的，自应当订立无固定期限劳动合同之日起向劳动者每月支付二倍的工资。