目前，中共中央编办、人力资源和社会保障部等有关部委正在抓紧制定《事业单位岗位绩效工资制度》。连同这份文件还有一份《关于分类推进事业单位改革的意见》。这两个文件将成为下一步事业单位工资改革的指导性文件。此外，据了解，一些部委已按照国务院的有关部署，开展了所属事业单位的资产清查、金融监管、调拨、人事制度等工作。这是为上述两个文件出台后事业单位工资改革做准备。我国有事业单位126万个，从业人员3000多万人，其中技术人员占70%以上。据知情人士介绍，这些事业单位大致可分为“公众参与（即指公务员）”、“全额拨款”、“财政补贴”和“自立”四类，在推进工资改革的过程中，有“财政补贴”的事业单位，得到的财政支持会逐渐减少，“自养”的事业单位最终会投放市场，但在此之前，还是会有一定的“过渡期”。从短期来看，“公众参与”和“全额拨款”的事业单位是相对“保险”的。此外，一些机构将被重组或剥离。知情人士透露，中央编办、人力资源和社会保障部等有关部委，正在抓紧制定《事业单位岗位绩效工资制度》和《关于分类推进事业单位改革的意见》，两个文件可以同时下发。这意味着事业单位工资改革将与事业单位改革同步进行

据参与工资改革的人员介绍，一些关系国家安全的事业单位，在政策和经济管理上具有明显的辅助作用，而且明显是公益性的将继续得到财政保障；目前，这类事业单位的工资分配大多采取“参照公务员”和“全额拨款”的形式。但在国家部委下属机构中，这一比例占少数。对一些业务突出的机构，主要是行业性或专业性业务，将继续给予资金支持。这类事业单位的工资收入主要以财政补贴的形式获得，但一些主要面向市场、已经开展经营活动的事业单位，将在有关部委的支持下尽快推向市场。此外，一些职能交叉、长期亏损、任务少的事业单位，也将进行重组或彻底剥离。中国人事科学院工资福利研究室主任何晓秋表示，目前事业单位的补贴情况比较复杂，在总收入中所占比重相差较大。如何将合理的补贴标准化为统一的岗位绩效工资制度而不引发新的矛盾，是一个亟待解决的问题

人力资源和社会保障部有关人士表示，事业单位工资改革的最终目标是将其尽可能推向市场，并使之成为现实一种咨询公司。但该人士表示，这是一种理想的模式，需要很长时间

目前，国务院有社科院、中科院等14个直属机构，国资委、科技部等29个相关部委，国家税务总局、工商总局直属机构18个，部委管理的国际局10个。在这些机构之下，相关机构的数量基本上是不同的。这些类型多、人员规模大的事业单位的工资改革成为这次改革的难点

事实上，中国科学院和中国社会科学院在2008年被选为工资改革试点，两年后，这两所“试错”事业单位的工资改革仍充满困难