有仲裁协议的管辖权异议提出时间只能在仲裁庭第一次开庭之前提出。仲裁立法时，应当考虑在仲裁当事人双方之间尽量求得一种平衡，做到既可以保证当事人就管辖权提出异议的正当权利，又可以把提出管辖权异议所不可避免造成的程序拖延，降低到最低的适当的程度，保护另一方当事人的正当权利。

一、提出管辖权异议的条件：

1、提出管辖权异议的主体应是本案的当事人，且只能是被告。因为，原告不存在提出异议的问题，原告的起诉本身就说明原告认为受诉法院具有管辖权。第三人也不能对管辖权提出异议。有独立请求权的第三人主动参加他人已开始的诉讼，应视为承认和接受了受诉法院的管辖，因而不发生对管辖权提出异议的问题。如果是受诉法院依职权通知他有管辖权的法院另行起诉。无独立请求权的第三人参加他人已开始的诉讼，是通过支持一方当事人的主张，维护自己的利益，由于他在诉讼中始终相辅助一方当事人，并以一方当事人的主张为转移。所以，他无权对受诉法院的管辖权提出异议。

2、当事人对管辖权的异议，应在提交答辩状期间提出。当事人对管辖权有异议的，必须在法定的答辩期间提出，当事人在答辩期间内未提出管辖权异议的，视为放弃了提出管辖权异议的权利，以后不得再提出。逾期提出的，人民法院不予审查。把提出管辖辖权异议限制在案件进入实体审理之间，是为了避免管辖权异议成立而造成的时间、人力、物力、财力的浪费；避免正在审理中的案件被不适当地中断迟延。

当事人提出的管辖权异议，符合上述两条件的，受诉人民法院应当进行审查。经过审查，当事人对管辖的异议成立的，人民法院应当作了书面裁定。将案件移送有管辖权的人民法院审理。异议不成立的，裁定予以驳回。裁定应当送达双方当事人。当事人对受诉法院的裁定不服的，可以在裁定书送达后10日内向上一级人民提出上诉。当事人在二审法院确定该案的管辖权后，即应按法院的通知参加诉讼。

二、管辖权异议申请后还开庭吗

根据《民事诉讼法》的规定，当事人对管辖权有异议的，可以在答辩状期间向受理法院提出异议，受理法院应当进行审查。异议成立的，裁定将案件移送有管辖权的人民法院；异议不成立的，裁定驳回。如果当事人对管辖权异议裁定不服的，还可以向上一级法院上诉。只有等法院就管辖权异议所作的裁定生效后，才能由有管辖权的法院来负责审理，确定开庭时间并通知双方当事人。

《最高人民法院关于适用中有关举证时限规定的通知》第三条的规定，关于当事人提出管辖权异议后的举证期限问题。当事人在一审答辩期内提出管辖权异议的，人民法院应当在驳回当事人管辖权异议的裁定生效后。

《民事诉讼法》第一百二十七条

规定，人民法院受理案件后，当事人对管辖权有异议的，应当在提交答辩状期间提出。人民法院对当事人提出的异议，应当审查。异议成立的，裁定将案件移送有管辖权的人民法院；异议不成立的，裁定驳回。

当事人未提出管辖异议，并应诉答辩的，视为受诉人民法院有管辖权，但违反级别管辖和专属管辖规定的除外。

《民事诉讼法》第一百六十四条规定，当事人不服地方人民法院第一审判决的，有权在判决书送达之日起十五日内向上一级人民法院提起上诉。

当事人不服地方人民法院第一审裁定的，有权在裁定书送达之日起十日内向上一级人民法院提起上诉。

被告提出管辖权异议，法院并没有书面通知，原定开庭时间重新确定。

三、指定管辖的管辖权异议怎么处理

1、首先，指定管辖是上级法院依职权指定其下级法院对某一案件实行审理，实质是法律赋予上级法院在特殊情况下有权变更和确定管辖法院，以适应审判实践的需要，保证案件及时正确的裁判。对指定管辖，下级法院应当服从，但是，当事人对法院的指定管辖可以在一定范围内表示接受或提出异议。本案的指定管辖是原告申请回避后形成的，被告尚未行使过权利。

2、其次，允许当事人对指定管辖提出异议，是程序公正的外在体现。指定管辖的案件，上级法院在指定时已经考虑了公正审判的因素，当事人再提管辖权异议，一般来说只是无谓的延长了诉讼期间。只有充分保障当事人的各项诉讼权利，当事人才能够在诉讼中维护自己的程序权利，进而保护自己的实体权利。

3、允许当事人对指定管辖的案件提出管辖权异议，体现了对当事人诉权的维护。另外，上级法院依受理案件的法院申请指定的过程中，可能因为没有听取被告的意见，所做的指定裁定也存在不太合理的地方，允许当事人提出管辖权异议，可以再给上级法院一个纠正的机会，避免让被告产生合理性怀疑。另外，我国民诉法对指定管辖的案件，没有规定当事人是否可以提出管辖权异议。

4、那么当事人在提出管辖权异议时，究竟是向接受指定的法院提还是向作出指定的法院提呢？法院接受异议后，程序上又如何处理？当事人应向接受指定的法院提出管辖权异议，如果异议不成立，则裁定驳回，当事人可提出上诉；如果异议成立，接受指定的法院则不能改变上级法院作出的指定管辖，而应报请上级法院裁定是否变更指定管辖。