1、根据我国的相关法律法规，在公司工作时患肺炎的，如果是传染病，应该隔离治疗。公司其他人员也应隔离消毒。生病雇员的工资应该正常支付。根据《中华人民共和国传染病防治法》第四十一条，甲类传染病发生地的县级以上地方人民政府或者该地特定区域的人员，可以实施隔离措施，同时向上一级人民政府报告，上级人民政府应当立即作出批准或者不批准的决定。上级人民政府决定不予批准的，实施隔离措施的人民政府应当立即解除隔离措施。

隔离期间，实施隔离措施的人民政府应当为被隔离人员提供生活保障；被隔离人员有工作单位的，其工作单位不得停止支付隔离期间的工作报酬。隔离措施的解除，由原决定机关决定并公告。（1）及时向卫生行政部门报告职业病患者。用人单位应当建立职业病报告制度，责任到人，责任到人。发现职业病患者，应当按照规定的期限和程序向卫生行政部门报告。不得虚报、漏报、拒报、拖延、伪造、篡改。