1、法定性不一样。公司章程依法是必须制定的；而股东合伙协议则法律没有要求股东必须签署，在法律规定的范围内，股东合伙协议是可有可无的。

2、约束的对象不同。股东合伙协议主要是对签署协议的各方股东有约束力；而章程则是对公司、股东监事、高级管理人员具有约束力。

一、有公司章程的法律效力

公司章程的法律效力是：

1、公司章程是公司的自治规章，每一个股东，无论是参与公司初始章程制订的股东，还是以后因认购或受让公司股份而加入公司的股东，公司章程对其均产生契约的约束力，股东必须遵守公司章程的规定并对公司负有义务。

2、股东违反这一义务，公司可以依据公司章程对其提出诉讼。但应当注意的是，股东只是以股东成员身份受到公司约束，如果股东是以其他的身份与公司发生关系，则公司不能依据公司章程对股东主张权利。

二、威海注册公司要什么条件

实践中，开公司一般有以下条件：

有固定的经营地点，有注册资金、有公司股东二人以上（如果没有股东，就你一个人也行）、公司章程，即对经营公司的规划、管理、利润分配、组织结构等，上述俱全就可以办公司了。

1、办理企业名称预先核准登记，大概3个工作日，在工商部门办理，办理时须提交名称、预先登记申请书、申请人身份证明或委托书、股东身份证明等材料，股东的出资比例。

2、办理好名称核准以后，工商部门会给你一张证明，然后持该证明到银行办理股东资本缴纳手续，开户并存入股东缴来的资金。

3、凭银行回单、股东协议书、企业名称预先核准通知书到会计师事务所进行验资。

4、正式登记。填好并持登记申请书、公司章程、验资报告、法定代表人登记表和身份证明、名称预先核准通知书、公司住所证明（经当地房屋租赁管理部门备案）等材料到工商部门进行正式的登记注册，一般15天内可办好。

法律依据：

《中华人民共和国公司法》第十条

公司以其主要办事机构所在地为住所。

《中华人民共和国公司法》第十一条

设立公司必须依法制定公司章程。公司章程对公司、股东、董事、监事、高级管理人员具有约束力。

三、公司自愿解散的情形是怎么样的

（一）公司章程规定的营业期限届满或者公司章程规定的其他解散事由出现。公司章程，是由有限责任公司设立时的全体股东制定，股份有限公司则是由发起人制定并经创立大会通过的，它对公司、股东、董事、监事及公司高级管理人员都有约束力。因此，公司章程规定的营业期限届满或者公司章程规定的其他解散事由出现时，股东会或股东大会可以决议解散公司。当然，股东也可通过修改公司章程而使公司存续。

（二）股东会或者股东大会决议解散；股东（大）会是公司的最高权力机构，有权决定解散公司。

（三）因公司合并或者分立需要解散；

（四）依法被吊销营业执照、责令关闭或者被撤销；这种解散属于行政强制解散，即在公司经营活动中，严重违反了工商、税收、劳动、市场、环境保护等对公司行为进行规制的法律法规和规章时，为了维护社会秩序，由相关主管部门予以取缔公司的主体资格。

（五）公司经营管理发生严重困难，继续存续会使股东利益受到重大损失，通过其他途径不能解决的，持有公司全部股东表决权百分之十以上的股东，可以请求人民法院解散公司。