公司迟到一次扣100不合理。用人单位对于迟到的员工进行扣除相应的工资是不符合法律规定的。但是在员工无正当理由迟到，因为迟到导致用人单位经济损失的，此时，用人单位就可以对员工的工资进行惩罚性的扣除，除此之外，劳动者还应当赔偿损失，用人单位也可以与劳动者解除劳动合同。

迟到一分钟扣一天的工资是违法的。上班迟到1分钟是可以根据规定减法工资的。用人单位可以制定用人制度来明确规定迟到后的处罚措施。

公司迟到罚款有哪些标准

用人单位不是行政机关，无权对员工实施行政罚款处罚。罚款，是行政处罚类型之一，依法由具有行政处罚权的行政机关作出。迟到属于劳动者不当履行劳动合同的行为，也属于违反用人单位考勤纪律的行为，用人单位有权采取适当的管理措施。用人单位要证明员工违纪事实就要有考勤卡或者其他证据作为基本依据。用人单位的规章制度应合法有效。规章制度的合法有效应具备三个要件：通过民主程序制定；不违犯国家法律、行政法规和政策的规定；已向劳动者公示。只有同时符合这三项要求，才是一个生效的、可执行的规章制度。如果认为用人单位关于迟到的规章制度不适当，劳动者有权向公司提出，通过协商予以修改完善。

《中华人民共和国劳动法》第九十一条用人单位有下列侵害劳动者合法权益情形之一的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金：

（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的；

（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的；

（三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；

（四）解除劳动合同后，未依照本法规定给予劳动者经济补偿的。