申请查处违法征地行为遇到妨害的，当事人可以向上一级的土地管理部门举报，必要时可以向检察院检举。

《国土资源行政处罚办法》

第八条有下列情形之一的，上级国土资源主管部门有权管辖下级国土资源主管部门管辖的案件：

(一)下级国土资源主管部门应当立案调查而不予立案调查的；

(二)案情复杂，情节恶劣，有重大影响的。

上级国土资源主管部门可以将本级管辖的案件交由下级国土资源主管部门管辖，但是法律法规规定应当由其管辖的除外。

第十一条国土资源主管部门发现自然人、法人或者其他组织行为涉嫌违法的，应当及时核查。对正在实施的违法行为，应当依法及时下达《责令停止违法行为通知书》予以制止。

《责令停止违法行为通知书》应当记载下列内容：

(一)违法行为人的姓名或者名称；

(二)违法事实和依据；

(三)其他应当记载的事项。

第十二条符合下列条件的，国土资源主管部门应当在十个工作日内予以立案：

(一)有明确的行为人；

(二)有违反国土资源管理法律法规的事实；

(三)依照国土资源管理法律法规应当追究法律责任；

(四)属于本部门管辖；

(五)违法行为没有超过追诉时效。

违法行为轻微并及时纠正，没有造成危害后果的，可以不予立案。

一、政府征地程序

1、拟订征用土地方案：由拟征用土地所在地市、县人民政府或其土地行政主管部门拟订。

2、审查报批：报有批准权限的上级政府批准。

3、方案公告：由市、县人民政府对经批准的征地方案在被征用土地所在地的乡(镇)、村予以公告。

4、征地补偿登记：被征用土地的所有权人和使用权人应当在公告规定的期限内，持土地权属证书到当地人民政府土地行政主管部门办理征地补偿登记。

5、制定征地补偿、安置方案：由市、县土地行政主管部门会同有关部门根据批准的征用土地的方案及土地所有者和使用者的登记情况(经核实)制定，即把征地方案中确定的各种补偿的总费用分配到各所有者和使用者，以及具体落实人员的安置方案。

6、公告征地补偿、安置方案并组织实施：征地补偿费用应当自征地补偿、安置方案批准之日起3个月内全部支付。

7、清理土地：征地补偿、安置方案实施后，由市、县土地行政主管部门组织有关单位对被征用的土地进行清理。