旷工3天自离的也有工资。法律规定：劳动者违反公司规定，擅自旷工自离的，用人单位按照员工工作天数支付相应的工资，但是该劳动者给用人单位造成的直接经济损失、招聘产生的费用，用人单位可以要求劳动者承担。

一、职工旷工一天扣三天工资合法吗

职工旷工一天扣三天工资不合法。旷工当天，用人单位可以不支付工资，除了给用人单位造成了经济损失外，不得额外扣工资的。因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

二、旷工三天自动离职要扣多少工资

旷工三天自动离职不扣除工资，全额支付工资。

旷工三天的，用人单位可单方面解除劳动合同。对用人单位造成损失的还需要承担赔偿责任。员工无违法违规行为，员工与公司协商一致办理离职手续的，公司应该全额支付工资。员工按照公司的规定自动办理离职手续，若是给用人单位造成损失的，用人单位可基于法律规定要求劳动者赔偿损失。用人单位在确认员工未按规定履行请假手续而擅自离岗，且无正当理由的，用人单位基于劳动者这一事实行为作出解除劳动合同的决定的，则需进行一下流程：

1、应通过各种渠道联系员工上班；

2、结清员工工资，并办理好社保手续；

3、保留好员工所有的档案及相关资料。

三、干了13天旷工自离有工资吗

干了13天旷工自离有工资，但也会被单位扣工资。劳动者没有提前三十天提出离职，用人单位也不存在劳动合同法的情况，未直接提交辞职信就走人，这个时候就是劳动者违法。用人单位应该全额支付劳动者工资，但是该劳动者给用人单位造成的直接经济损失、招聘产生的费用，用人单位可以要求劳动者承担。