一、一次性发放的加班工资如何扣税

一次性发放全年加班费，可以合并到各月的工资、薪金所得中，超过纳税标准的，分月缴纳个人所得税。

二、法律规定

对企业平时月份已发放工资，又一次性补发数月或者全年的奖金、补贴、加班费等收入，根据《国家税务总局关于调整个人取得全年一次性奖金等计算征收个人所得税方法问题的通知》(国税发[2005]9号)的规定，雇员取得除全年一次性奖金以外的其它各种名目奖金，如半年奖、季度奖、加班奖、先进奖、考勤奖等，一律与当月工资、薪金收入合并，按税法规定缴纳个人所得税。