用人单位如果克扣劳动者工资的处理办法是双方当事人协商解决，无法达成协商的申请调解，再者当事人向仲裁委员会提起仲裁，最后才向法院提出诉讼请求。

一、用人单位如果克扣劳动者工资怎么办

用人单位如果克扣劳动者工资可以按照以下四种办法进行处理：

1.协商解决。劳动者与用人单位就劳动纠纷问题直接进行协商，这不是必经程序，双方可以协商，也可以不协商，完全出于自愿。

2.申请调解。当事人就已经发生的劳动纠纷向劳动纠纷调解委员会申请调解的程序。调解程序也由当事人自愿选择，调解协议不具有强制执行力，如果一方反悔，同样可以向仲裁机构申请仲裁。

3.仲裁处理。当事人将纠纷提交劳动争议仲裁委员会进行处理的程序，如果想提起诉讼打劳动官司，必须经过仲裁程序，不能直接向人民法院起诉。

4.诉讼解决。诉讼程序的启动是由不服劳动争议仲裁委员会裁决的一方当事人向人民法院提起诉讼后启动的程序。

二、公司克扣工资该怎么投诉

对地企业克扣工资，员工可以选择以下方式进行投诉：

1.打劳动保障热经12333投诉，这个电话全国统一，投诉时需要实名投诉，要提供本人的身份证号码、姓名。你可以多打几次进行投诉

2.到当地劳动站、人力资源和社会保障局的劳动监察大队投诉

这些机构是专业处理劳资纠纷的，他们会上门查处克扣工资的违法行为。

三、克扣工资的诉讼时效

克扣工资劳动仲裁时效是一年，对裁决不服可以再起诉。劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。劳动争议案件的时效是指劳动争议的仲裁时效和劳动争议的诉讼时效。超过劳动争议案件的仲裁时效提起劳动争议诉讼的胜诉权丧失。

劳动争议案件的仲裁时效，是《中华人民共和国劳动法》规定的六十天，是指当事人自知道或者应当知道自己的劳动合同权利被侵犯之日算至以后的六十日(不含因不可抗力而中断的期间)内向劳动争议仲裁委员会提起劳动争议仲裁。