主合同和补充协议之间的关系有：补充协议是对原合同内容的补充或者变更，不影响原合同的有效性，补充协议条款与原合同内容不一致或发生冲突的，以补充协议为准。

一、补充协议有无效必要条件

补充协议是对原合同的补充或者变更，一般要明确约定，如果补充协议条款与原合同不一致或发生冲突时，应当与补充协议为准，但原合同明示不得变更的条款，补充协议中对该条款发生的变更则不发生法律效力。1、只要不违反法律的禁止性和限制性规定,且充分尊重当事人双方的意思自治，协议内容合法有效的话，补充协议与主合同的效力是同等的。2、在补充协议与主合同发生冲突时，视为对主合同的变更或撤消，其效力优于主合同。即补充合同中与主合同相冲突的条款，补充协议的条款优先适用。

二、合同金额超了，怎么写补充合同

首先，依据我国民法典的规定，合同的金额写少了，通过补充协议的方式解决是可以的，而补充协议要以书面的形式写，并且由双方签字。

其次，书写补充协议时要注意：

一是双方当事人的基本信息需全面具体；

二是说明拟定补充协议的原因；

三是协议补充的内容或变更的内容。当补充合同的约定与主合同的约定发生矛盾时，应该以时间在后的约定条款为准执行。

三、合同上手写补充是否是有效的

合同上手写补充是双方协商的条款就是有效的。补充协议条款与原合同不一致或者发生冲突的，以补充协议为准。此外，不建议在合同补充条款上手写和盖章变更合同。最好的解决办法是签订补充协议，这样可以更好地保护双方的权益。当然，如果在原合同手写的条款与原合同中的条款有歧义或明显差异，则以手写条款为准。