当补充合同的约定与主合同的约定发生矛盾时，应该以时间在后的约定条款为准执行。时间在后的约定，实际上是对主合同的原约定的重新修订，该新约定是补充合同的精要和实质。已经存在的合同与“补充协议”之间是主从关系。已经存在的合同是主合同，“补充协议”是从合同。

一、合同附件与合同补充协议的区别是什么

合同附件与合同补充协议的两个区别如下：

1、合同补充协议是对原合同未尽或合同履行过程中出现的新情况另行约定，合同附件与合同具有相同的法律效益，是合同的组成部分，如无明确约定，附件可用于解释合同，附件应服从合同约定，因此，合同补充协议是对合同及其附件中未约定的事项的补充协议；

2、合同附件和补充协议都有法律效力，但两者还是有区别的，附件只在主合同中约定见附件，实际上是主合同的组成部分，补充协议是不同的，补充协议与主合同有冲突或矛盾的，以补充协议为准。

二、合同补充条款的效力应该是怎样的

合同补充条款与合同具有同等法律效力。合同是双方设立、变更、终止民事关系的协议。按规定成立的合同受法律保护。补充合同约定与主合同约定发生冲突时，以后期约定条款为准。事实上，时间后的协议是对主合同原协议的重新修订，新协议是补充合同的本质和本质。若仍以主合同原条款为准执行，则失去了补充合同的意义。

三、合同补充条款的效力是怎么样的

合同补充条款与合同具有同等法律效力。合同是当事人或当事双方之间设立、变更、终止民事关系的协议。依法成立的合同，受法律保护。

当补充合同的约定与主合同的约定发生矛盾时，应该以时间在后的约定条款为准执行。

时间在后的约定，实际上是对主合同的原约定的重新修订，该新约定是补充合同的精要和实质。如果仍以主合同的原条款为准执行，那就失去了补充合同存在的意义。