病假两年后，按照劳动合同的经济补偿金计算，但约定的经济补偿金不能低于对应的职位的工资标准。在劳动合同中没有约定的，有工会的或者职工代表的，可以在集体劳动合同中约定病假的工资计算基数，如没有工会的，则之间按照当前的工资的70％计算工资，单位是不能随便扣职工工资的。

解除劳动合同经济补偿金如何算

解除劳动合同经济补偿金计算标准如下：

1、经济补偿金的标准是每满一年支付一个月工资的标准；

2、如果是六个月以上不满一年的，按一年计算；未满六个月的，支付半个月工资。

支付经济补偿的年限最高不超过十二年。法律规定了劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的；劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的，需要支付经济赔偿金。

《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》第三条企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期：

（一）实际工作年限十年以下的，在本单位工作年限五年以下的为三个月，五年以上的为六个月。

（二）实际工作年限十年以上的，在本单位工作年限五年以下的为六个月，五年以上十年以下的为九个月，十年以上十五年以下的为十二个月，十五年以上二十年以下的为十八个月，二十年以上的为二十四个月。