一、农村非法转让土地使用权会怎么处罚

1、农村非法转让土地使用权罪的处理是，要没收非法转让土地的违法所得，擅自将农用地改为建设用地的;

视土地利用总体规划情况，限期拆除或没收在非法转让的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处非法所得50%以下罚款。

2、法律依据：根据《土地管理法》第七十三条，对买卖或者以其他形式非法转让土地行为，要没收非法转让土地的违法所得;

擅自将农用地改为建设用地的，视土地利用总体规划情况，限期拆除或没收在非法转让的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处非法所得50%以下罚款。

二、如何认定村委会非法转让土地使用权

1、法取得的土地使用权违法转让的，违法所得为当事人转让全部所得扣除当事人依法取得土地使用权的成本和对土地的合法投入。例如，某企业以出让方式依法取得土地使用权用于房屋建设，已经支付了全部土地出让金等相关费用，并进行了投资开发，但完成开发投资总额未到达不符合法律规定条件即将房地产进行了转让，属于违法转让土地使用权行为，给予没收违法所得的行政处罚。在认定违法所得时，应当从转让房地产的总收入中扣除违法当事人已缴纳的土地出让金等相关费用成本和开发建设投入。