目前，国家层面对征地补偿金能否保留没有规定。一般来说，经农村集体协商同意的，留用是合法的。《中华人民共和国村民委员会组织法》第二十四条下列涉及村民利益的事项，经村民会议讨论决定后，可以办理：

（一）享受补贴的村的人员和补贴标准误工补助费；

（2）村集体经济收入的使用情况；

（3）村公益事业的设立和筹资计划及施工承包计划；

（4）土地承包经营计划；

（5）项目审批和承包村集体经济项目计划；

（六）宅基地使用计划；

（七）征地补偿费使用和分配计划；

（八）以借贷、租赁等方式处分村集体财产；（九）村民会议认为应当由村民会议讨论决定的其他涉及村民利益的事项。村民会议可以授权村民代表会议讨论决定前款规定的事项。

法律对讨论、决定村集体经济组织的财产和成员权益另有规定的，从其规定。