劳动者如何赔偿以及赔偿的方式，主要依据《工资支付暂行规定》第十六条，该条规定：“因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。”

具体确定劳动者赔偿额度及比例时，要依据双方劳动合同的约定或单位规章制度的规定，根据过错的大小、损害的程度，参照劳动者的工资收入水平，确定劳动者应赔偿的数额。

经济赔偿规定：凡造成经济损失的，直接责任人按下列比例标准承担赔偿责任。

(1)经济损失在50～1000元以下的，直接责任人按100%进行赔偿；

(2)经济损失在1000～2000元及以下的，直接责任人按80%进行赔偿；

(3)经济损失在2000～5000元的，直接责任人按30%进行赔偿；

(4)经济损失超过5000元的，直接责任人按5～20%赔偿。

赔偿处罚操作：

(1)根据国家《工资支付暂行规定》第十六条规定，经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。

(2)当月的20%工资不足赔偿全额时，则分月扣除，直至赔偿金额扣完为止。

(3)若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

(4)对相关责任人的处罚，也按上述规定执行