两个单位都有工资怎么纳税要视情况而定，具体情况如下：

1、如果是单位派到另一个单位工作的，在被派遣的单位计算个税时，应按工资薪金所得计算个税，即可以扣除相关费用，如生计费和社会保险，余额就是应税所得额，然后按适用税率计算应缴纳税额；原单位不能扣除相关费用，工资直接按适用税率计算应纳税额；

2、如果是在两个单位兼职工作的，每个单位都按劳务报酬所得计算个人所得，如果本来有单位，又兼职了一个单位的工作，那么原单位的工资按工资薪金所得计算个税，兼职的单位工资按劳务报酬所得计算个税。

个人所得税的税率是，综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率；经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率；利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。