1、应当告合并后的单位或者分立后的单位。但在提起劳动诉讼前，一般需要先申请仲裁。而用人单位合并或者分立的，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的单位继续履行。

2、法律依据：

《中华人民共和国劳动合同法》

第三十三条用人单位变更名称、法定代表人、主要负责人或者投资人等事项，不影响劳动合同的履行。

第三十四条用人单位发生合并或者分立等情况，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行。

《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》

第五条

发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。

一、用人单位分立合并时劳动合同该如何履行

1、首先，用人单位分立、合并后，劳动合同仍然有效，如果用人单位与员工之间没有就劳动合同的处理事宜作出任何约定，则劳动合同应由分立、合并后的用人单位继续履行。

2、原用人单位可以在分立合并前，按照劳动法第二十六条第三项

“劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化”，解除与员工的劳动合同，但必须按劳动法向员工支付经济补偿金。

3、原用人单位及分立合并后的用人单位也可以与员工就劳动合同的变更作出约定，既包括劳动合同主体的变更，也包括劳动合同内容的变更。但在变更劳动合同的过程中要遵循协商一致的原则。如协商不成，则原劳动合同仍然有效，双方应当执行。变更劳动合同的方式一般为解除原劳动合同并重新签订劳动合同。

4、但是新劳动合同并不是一份真正意义上的新的劳动合同，根据劳动部有关文件，在这种情况下重新签订的劳动合同是原劳动合同的变更。因此虽然在名义上有解除原劳动合同的行为，但员工不能要求用人单位依劳动法中有关经济补偿的条款要求补经济补偿。