1、协议中要说明子女有谁抚养，抚养费如何承担以及探望权如何行使。

2、可以对分居期间的财产进行约定，如无约定或无法达成协议，则仍视为夫妻共同财产。双方若同意，可以在协议中规定分居期间双方不再互相享有家事代理权（但无法对抗善意第三人），如果一方违反则要赔偿另一方的损失。双方若同意，可以约定分居期间因为一方而产生的债务一律视为个人债务（同样无法对抗善意第三人），一方如果违反要赔偿另一方的损失。

3、分居的期限，应以三个月至两年为限，期限届满，如一方当事人依然认为感情无法复合而要求离婚的，可协议离婚或持该协议向法院起诉离婚。

4、分居的终止。协议分居可基于当事人双方的协议而终止，但应当制作终止分居的书面协议，或办理终止分居的公证。

实践中，几乎所有公证处都没有将分居协议明确列入民事协议公证的范围，当事人如果在当地公证处拒绝受理的情况下，可选择找当地律师事务所律师见证，或两个邻居，同事见证的方式，或者只要双方同时签字认可即可，而不必公证及见证。

一、分居协议关于财产的分割能否有法律效力

只要协议内容真实合法，财产分割就具有法律效力。在订立分居协议时，一般会在协议中约定，协议生效后，夫妻财产实行分别财产制，即各自所有，所得财产归各自所有，财产关系不再共有。同样，分居期间的债务，除赡养老人和子女外，视为个人债务。分居期限可由当事人协商确定，一般从几个月到几年不等。分居协议一般在双方签署协议后生效。