公司破产程序中可以申请仲裁。仲裁效力及于公司，仲裁由清算组参与。根据相关法律规定，申请仲裁一定要在合同中载明。只能约定仲裁或者是诉讼，不能有两种争议解决方式。

一、房屋租赁合同是否可以约定仲裁管辖

房屋租赁合同可以约定仲裁管辖。

当事人可以通过和解或者调解解决合同争议。

当事人不愿和解、调解或者和解、调解不成的，可以根据仲裁协议向仲裁机构申请仲裁。涉外合同的当事人可以根据仲裁协议向中国仲裁机构或者其他仲裁机构申请仲裁。当事人没有订立仲裁协议或者仲裁协议无效的，可以向人民法院起诉。当事人应当履行发生法律效力的判决、仲裁裁决、调解书;拒不履行的，对方可以请求人民法院执行。

二、借款合同纠纷如何解决?

借款合同纠纷解决方式是：1、双方能协商一致的，协商解决；2、协商不成的，合同中有约定争议解决机制的依约定，如合同有约定仲裁条款的，只要该约定条款符合法律规定，纠纷就只能通过仲裁解决，排除法院管辖。合同中没有约定仲裁条款，但有约定法院管辖的，只要相关约定符合法律规定，就由约定的法院管辖；3、合同中无约定解决机制的，可以至法院提请诉讼，根据《民事诉讼法》第二十三条，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。

三、如何选择合同争议解决方式？

合同争议解决方式分别有约定、协议、诉讼和仲裁。有约定的按约定；没有约定的协议优先；协商不成的可以申请基层组织进行调解；调解不成的可以向法院起诉；当事人有签订仲裁协议或仲裁条款的，可以申请仲裁机构进行仲裁。法律其他规定等。