不会扣工资，根据相关法律规定，劳动者离职需要提前通知用人单位，一般情况下，即使劳动者自离，用人单位也不得扣除劳动者的工资，除非因为劳动者自离给用人单位造成了损失，用人单位才可以要求劳动者赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％，若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

员工自离需要扣代通知金吗

员工自离的是没有待通知金的，代通知金是指用人单位按劳动合同法第四十条规定解除劳动合同时，用多支付劳动者一个月工资代替这个提前通知期，主要是为了补偿劳动者在失业时重新寻找工作所需要的时间的利益，代通知金按劳动者上月工资支付。

《中华人民共和国劳动法》第五十条工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。

《工资支付暂行规定》第十六条因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

《中华人民共和国劳动合同法》第九十条劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。