一、工伤认定单位不认时单位员工应该如何处理

1、申请工伤认定时单位不认为是工伤的，单位员工可收集相关的证明材料来依法向劳动保障行政部门申请。社会保险行政部门工作人员无正当理由不受理工伤认定申请，依法给予处分;情节严重，构成犯罪的，依法追究刑事责任。

2、法律依据：

《工伤保险条例》第十九条

社会保险行政部门受理工伤认定申请后;根据审核需要可以对事故伤害进行调查核实，用人单位、职工、工会组织、医疗机构以及有关部门应当予以协助。职业病诊断和诊断争议的鉴定，依照职业病防治法的有关规定执行。对依法取得职业病诊断证明书或者职业病诊断鉴定书的，社会保险行政部门不再进行调查核实。

职工或者其近亲属认为是工伤，用人单位不认为是工伤的，由用人单位承担举证责任。

二、员工受伤是否属于工伤,用人单位应如何申请工伤认定

职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区劳动保障行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报劳动保障行政部门同意，申请时限可以适当延长。按照前款规定应当向省级劳动保障行政部门提出工伤认定申请的，根据属地原则应向用人单位所在地设区的市级劳动保障行政部门提出。