是否合法就要看扣多少；依据我国相关法律的规定，劳动者给公司造成严重损失的，扣除劳动者工资不得超过工资的20%，并且发的工资不得低于最低工资标准，扣除全部工资是不合法的。

《工资支付暂行规定》

第十六条因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

一、公司克扣工资怎么办

公司无没有正当理由克扣工资的，员工可以采取以下方式来维护自身权益：

1、与公司协商。公司扣工资的，一般要说明扣工资的理由，通常是所依据的相关规章制度，但前提是这个相关规章制度是已经过事前公开公示，否则，公司属于无正当理由克扣工资，属于无理的违法行为，职工可以要求公司全额支付工资及相应利息损失。

2、如协商不成的，可以到当地的劳动监察大队投诉，要求协助处理解决。

3、如仍未解决的，可以至当地的劳动仲裁机构申请劳动仲裁处理解决。

4、如劳动仲裁生效后，公司拒绝执行并拒付的，可以申请法院强制执行。

用人单位一般不得克扣劳动者工资，有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：

1、用人单位代扣代缴的个人所得税；

2、用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；

3、法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；

4、法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。

综合上面所说的，扣除工资的做法只要在合同中有约定，那么就可以实施这做行为，但对于在扣除的时候也要看对公司是否造成了很大的影响，从而再确定是否可以扣除多少，因此，扣工资这种做法是可以得到法律支持的，从而也可以让违法者付出相应的代价。