根据我国有关法律法规，劳动保障行政部门认为用人单位违反劳动保障法律、法规或者规章，需要查处的，应当及时立案。

劳动保障监察条例第十四条劳动保障监督采取日常检查、审查用人单位按规定提交的书面材料、受理举报、投诉等形式，对劳动保障行政部门认为用人单位违法的行为进行监督，劳动和社会保障规章制度，需要查处的，对违反劳动保障法律、法规、规章造成的群体性事件，劳动保障行政部门或者受委托实施劳动保障监督的组织应当及时立案，劳动保障行政部门应当及时会同有关部门按照应急预案处理，有哪些问题劳动监察部门不予受理的，用人单位违反劳动和社会保障法规定不予赔偿的违反劳动保障法律、法规，或者给劳动者造成损害的，应当依法赔偿，劳动者与用人单位发生争议的，依照国家有关劳动争议的规定处理。因劳动合同终止，双方未能就经济补偿达成协议的，应当申请劳动仲裁。劳动保障监察部门不予受理。

2.劳动争议已经解决或者提起诉讼的事项。劳动和社会保障部门应当通知申诉人办理应当通过劳动争议解决程序解决的事项，或者按照劳动争议解决程序申请调解、仲裁、诉讼的事项。用人单位拖欠工资，劳动者已向劳动仲裁委员会申请仲裁的，不得再向劳动和社会保障监督部门投诉调查

3.劳动安全卫生监督检查的有关事项。劳动安全卫生监督检查由卫生部门、安全生产监督部门、特种设备安全监督管理部门等有关部门依照有关法律、行政法规的规定进行。如用人单位违反职业病防治法的规定，未对劳动者采取卫生防护措施的，由卫生监督部门责令改正或者处罚。对此，劳动和社会保障监察部门没有管辖权

用人单位的违法行为已经两年多了。用人单位违反劳动保障法律、法规、规章的行为，劳动保障部门在两年内没有发现、报告或者投诉的，劳动保障部门不予查处。如果违法行为是连续的或连续的，则从终止之日起计算